Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM60Q9H2L4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM60Q9H2L4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms