Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX4Q9H1E5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TMX4Q9H1E5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms