Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LSG1Q9H089 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSG1Q9H089 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms