Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIF3L1Q9GZT8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NIF3L1Q9GZT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms