Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
C20orf27Q9GZN8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C20orf27Q9GZN8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C20orf27Q9GZN8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms