Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC27Q9C0I9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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