Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12CQ9C0D7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms