Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIPCQ9C0C6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms