Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP4Q9C0A0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP4Q9C0A0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms