Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FOXP3Q9BZS1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXP3Q9BZS1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms