Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS3Q9BZE2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUS3Q9BZE2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms