Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms