Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP2-4Q9BYR9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms