Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PCGF6Q9BYE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCGF6Q9BYE7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms