Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRTQ9BXP5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRTQ9BXP5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms