Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms