Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SALL3Q9BXA9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms