Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC94Q9BW85 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms