Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP8Q9BV40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms