Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK3BQ9BT76 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms