Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C2orf88Q9BSF0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C2orf88Q9BSF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms