Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms