Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYM1Q9BRP8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PYM1Q9BRP8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms