Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDXACB1Q9BRP7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDXACB1Q9BRP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms