Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SGIP1Q9BQI5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SGIP1Q9BQI5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms