Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOPXQ9BPY8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOPXQ9BPY8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms