Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED1Q99966 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms