Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN18Q99952 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms