Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS3Q99687 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MEIS3Q99687 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3Q99687 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms