Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms