Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YME1L1Q96TA2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms