Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms