Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGAP1Q96PV0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGAP1Q96PV0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms