Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OPALINQ96PE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
OPALINQ96PE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OPALINQ96PE5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms