Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms