Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1Q96NA8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1Q96NA8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms