Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP295NLQ96MC4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP295NLQ96MC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP295NLQ96MC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP295NLQ96MC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP295NLQ96MC4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP295NLQ96MC4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP295NLQ96MC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP295NLQ96MC4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms