Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC114Q96M63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms