Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABS1Q96KC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABS1Q96KC9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms