Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VSIG2Q96IQ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSIG2Q96IQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms