Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHFRQ96EP1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHFRQ96EP1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms