Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms