Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C18orf8Q96DM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C18orf8Q96DM3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C18orf8Q96DM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms