Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB2Q96DC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms