Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms