Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSUN4Q96CB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSUN4Q96CB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms