Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDCCAG3Q96C92 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms