Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD2Q96BF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms