Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTSSAQ969W0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms