Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP4Q969E2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms